将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！ 这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！ 神龟们又处于备战状态了！他们再次联合起来，准备向黑暗势力出击！
演员：艾伦·图代克 杰弗里·怀特 艾利奥特·佩吉 杨紫琼 杰拉德·巴特勒 罗素·克劳 莫妮卡·贝鲁奇 卡尔·厄本 大卫·田纳特 范·迪塞尔 扎恩·迈克拉农 马尔科姆·麦克道威尔 迪·布拉雷·贝克尔 黛芙芮·雅各 塔坦卡·米恩斯 朱丽叶特·米尔斯 玛德琳·麦登 拉加·拉格纳斯 奥德丽·瓦西莱夫斯基 袁文忠
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演员：贾斯汀·弗莱彻 约翰·斯帕克斯 欧米德·吉亚李利 理查德·韦伯 凯特·哈伯 安迪·尼曼 西蒙·格林诺 艾玛·泰特 蒂姆·汉兹 杰克·保尔森 西恩·康诺利 亨利·伯顿 迪曼特·维瓦斯 苏菲·劳顿 妮娅·梅迪·詹姆斯 斯坦利·昂温
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