本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。在跨越无数的试练后，武藤游戏与身体内的另一人格“暗游戏”进行最终决战并获胜，在作出正式诀别后踏上各自的旅途。在经历一段时间后，游戏等人重新回归平凡的生活。然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
演员：渡边久美子 小樱悦子 中田让治 川上伦子 斋藤千和 子安武人 草尾毅 平松晶子 池泽春菜 能登麻美子 广桥凉 石田彰 下野纮 桧山修之 金田朋子 高山南 堀江由衣 福田沙纪 高桥研二 荻野晴朗 前野智昭 广田诗梦 日笠阳子 藤原启治
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演员：木村珠莉 佳村遥 千菅春香 高野麻美 大和田仁美 佐仓绫音 松风雅也 桧山修之 斋藤宽仁 滨田贤二 山冈百合 米泽圆 叶山郁美 田丸笃志 松本忍 间岛淳司 高梨谦吾 伊藤静 日野麻里 茅野爱衣 沼仓爱美 山川琴美 井泽诗织 小柳基 西地修哉 吉野裕行 小林裕介 中原麻衣 小伏伸之 兴津和幸 滨野大辉 高木涉 铃村健一 汤浅枫 室元气 樱井孝宏 横尾麻里 菅原雅芳 桥本千波 岩田光央 野濑育二 高桥李依 高桥伸也 保村真 小西克幸 江越彬纪 山本格 齐藤次郎 福岛润 庆长佑香 山岸治雄 春日望 金元寿子 菅
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